Регистрация событий, которые происходят на сетевом оборудовании важный инструмент доступный через CLI устройтсва. Информацию можно анализировать в реальном времени, а так же получать историю о уже произошедших событий, тем самым своевременно устранять возникающие проблемы. Система регистраций JunOS очень похожа на syslog Unix. Программное обеспечение представляет два механизма для протоколирования событий: log messages (иногда называют syslog) - генерирует сообщения в системный журнал, производит запись событий, которые происходят в системе; traceoptions - является специфичным для конкретных сервисов и протоколов маршрутизации и записывает информацию о их работе.

В системе JUNOS существует два режима конфигурации оборудования shell (можно работать непосредственно с BSD системой и ее процессами) и cli (работа идет непосредственно с конфигурацией конфига оборудования).
Для того чтобы зайти в режим cli нужно ввести «cli», для режима shell вводим «start shell».